MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 plasmid pMETVU02

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013409	ATA	2	6	10	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013409	TGT	2	6	31	36	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013409	ATT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013409	T	7	7	132	138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013409	TAT	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013409	TAA	2	6	156	161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013409	T	6	6	175	180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013409	ATT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013409	AG	3	6	279	284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013409	TAATTG	2	12	328	339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013409	ATA	2	6	409	414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013409	ATA	2	6	991	996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013409	AAAT	2	8	1007	1014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013409	CCAAT	2	10	1019	1028	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013409	GTT	2	6	1044	1049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013409	TTATGA	2	12	1083	1094	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013409	T	6	6	1111	1116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013409	AG	3	6	1136	1141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013409	TTA	2	6	1147	1152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013409	TA	3	6	1151	1156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013409	ATATTT	2	12	1214	1225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013409	T	6	6	1223	1228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013409	ATA	2	6	1239	1244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013409	ATC	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013409	AC	3	6	1252	1257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013409	T	6	6	1284	1289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013409	AAC	3	9	1304	1312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013409	A	7	7	1335	1341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013409	TA	3	6	1343	1348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013409	T	6	6	1360	1365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013409	ATA	2	6	1377	1382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013409	TAA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013409	A	6	6	1493	1498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013409	GTT	2	6	1530	1535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013409	TAA	2	6	1555	1560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013409	ATA	2	6	1616	1621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013409	ATT	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013409	TAG	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013409	T	6	6	4691	4696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013409	TA	3	6	4699	4704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.